Atas kejadian ini rakyat Indonesia kemudian menuntut Presiden Soekarno untuk membubarkan PKI, padahal PKI merupakan kekuatan terbesar yang mendukung gerakan "Ganyang Malaysia" milik Soekarno.
Soekarno kemudian memerintahkan Mayor Jendral Soeharto untuk membersihkan unsur pemerintahan dari pengaruh PKI.***